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為了配合中醫藥發展方向，基金亦不時推出其他支援計劃，包括：「策略性主題委託項目資助計劃（C計劃）」、「國家中醫藥管理局與香港特別行政區醫務衞生局合作的香港中醫藥人才培訓項目」及兩項2019冠狀病毒病特別支援計劃等。
